Met ingang van 12 maart 2002 geldt voor de vergoeding van kosten, die een belastingplichtige heeft gemaakt in de bezwaar- of beroepfase de wettelijke regeling uit de Algemene Wet Bestuursrecht. Verzoeken om kostenvergoedingen worden nu door de belastingdienst afgehandeld. Verzoeken om kostenvergoeding, die betrekking hebben op eerdere besluiten worden door het Ministerie van Financiën behandeld. Datzelfde geldt voor verzoeken om vergoeding van schade, die een belastingplichtige door toedoen van de belastingdienst heeft geleden. Met ingang van 1 oktober 2003 is de belastingdienst bevoegd om ook de verzoeken om kostenvergoeding voor besluiten van voor 12 maart 2002 af te handelen. Ook verzoeken om schadevergoeding mogen door de belastingdienst worden behandeld, tenzij de schade groter is dan € 5.000. Het daartoe strekkende besluit van de staatssecretaris van Financiën is voorzien van een bijlage, die een instructie voor de belastingdienst bevat.