De uitvoeringsregeling energie-investeringsaftrek is gewijzigd per 1 januari 2004. De wijziging betreft de aanpassing van de energiebesparende bedrijfsmiddelen en onderdelen daarvan aan de stand van de techniek.In 2003 is de voorwaarde ingevoerd dat, indien voor de investering een bouwvergunning noodzakelijk is, de energie-investeringsaftrek alleen van toepassing is voor die investeringen waarvoor de belastingplichtige beschikt over een definitieve bouwvergunning op het moment van de aanmelding. Deze voorwaarde geldt nu ook voor investeringen waarvoor een vergunning ingevolge de Wet beheer Rijkswaterstaatswerken noodzakelijk is.