
Er geldt op verzoek een apart regime voor de bepaling van de winst uit de exploitatie van zeeschepen. Bij toepassing van dat regime wordt de winst bepaald aan de hand van de tonnage van de schepen waarmee die winst wordt behaald. Andere activiteiten dan de exploitatie van zeeschepen vallen onder het normale regime van winstbepaling.
Als een onderneming zowel winst uit zeescheepvaart als normaal belaste winst geniet, hangen de niet rechtstreeks aan een van beide resultaten toerekenbare algemene kosten samen met alle ondernemingsactiviteiten. Deze algemene kosten moeten volgens een passende bedrijfseconomische verdeelsleutel aan beide winstgenererende activiteiten worden toegerekend.
In een procedure waarin op een vennootschap zowel de tonnageregeling als de normale winstbepaling van toepassing was, rekende de rechtbank de algemene kosten van de vennootschap toe volgens de verhouding van het met normaal belaste winst gemoeide vermogen en het totale vermogen. Hof Leeuwarden vond dat de door de inspecteur niet in aftrek toegelaten kosten ten laste van de normaal belaste winst konden worden gebracht. De Hoge Raad deelt die opvatting niet en heeft de uitspraak van het hof vernietigd. Hof Amsterdam moet nu bepalen wat een passende bedrijfseconomische verdeelsleutel is.