
Door de invoering van de zogenaamde MKB-winstvrijstelling is een deel van winst van een ondernemer vrijgesteld van inkomstenbelasting. De vrijstelling bedraagt 12% (aanvankelijk 10%) van de winst na toepassing van de ondernemersaftrek. Wanneer de winst uit onderneming of de winst na vermindering met de ondernemersaftrek negatief is, is de MKB-winstvrijstelling ook negatief. In dat geval vermindert de MKB-winstvrijstelling dus het verlies uit onderneming.
Volgens Hof Den Haag heeft de wetgever dat uitdrukkelijk zo gewild. De bedoeling van de MKB-winstvrijstelling is het bereiken van een verlaging van de belastingheffing over de winst uit onderneming. In plaats van te kiezen voor verlaging van de belastingtarieven is gekozen voor de invoering van een gedeeltelijke vrijstelling van de winst. Bij de parlementaire behandeling van het betreffende wetsvoorstel is gevraagd of door de MKB-winstvrijstelling 10% van een verlies niet meer aftrekbaar is. Door de vrijstelling van 10% wordt de grondslag, waarover belasting wordt geheven, verkleind.
Winst is een algebraïsch begrip en omvat zowel positieve als negatieve winsten (verliezen). De MKB-winstvrijstelling is dus ook van toepassing in geval van verlies. Op deze wijze is het effect van de vrijstelling vergelijkbaar met verlaging van de belastingtarieven.