In de Tweede Kamer zijn vragen gesteld over de eisen die worden gesteld aan besturingssystemen van computers om de voor bedrijven verplichte elektronische belastingaangifte te kunnen doen. De staatssecretaris van Financiën heeft geantwoord dat er geen strijd is met het zogenaamde open source beleid voor besturingssystemen omdat bedrijven kunnen kiezen voor commerciële software die beschikbaar is voor verschillende besturingssystemen of voor de basisvoorziening van de Belastingdienst. Op die manier stelt de Belastingdienst elektronische formulieren beschikbaar. Afhankelijk van de belastingsoort zijn er verschillende methoden. In sommige gevallen gaat het om PDF-bestanden. Het voor het invullen benodigde programma is nog niet beschikbaar voor Linux. Particulieren kunnen inmiddels hun aangifte Inkomstenbelasting doen op Apple Mac OS. Voor 1 januari 2006 zal het ook mogelijk zijn om dit met Linux te doen. De staatssecretaris is niet van plan om vaker ontheffing te verlenen van de verplichting om elektronisch aangifte te doen.