Bij het vaststellen van een aanslag wordt heffingsrente berekend. De periode waarover heffingsrente wordt berekend begint voor de inkomstenbelasting op 1 juli van het kalenderjaar waarover de belasting wordt geheven en eindigt op de dag van de dagtekening van het aanslagbiljet. In bepaalde gevallen moet de belastingdienst de berekening van heffingsrente matigen. Volgens een besluit van de staatssecretaris van Financiën dient een aanslag namelijk binnen drie maanden na het indienen van een aangifte te zijn vastgesteld. Duurt dat langer door toedoen van de belastingdienst, dan mag over de periode daarna geen heffingsrente worden berekend. Hetzelfde geldt voor het verzoek aan de belastingdienst om een voorlopige aanslag op te leggen. De rechtbank Den Haag verminderde de berekende heffingsrente in een geval waarin meer dan 1 jaar was verstreken vanaf het moment waarop de aangifte was ingediend tot de aanslag was vastgesteld. Alleen over de eerste drie maanden mocht heffingsrente worden berekend.