Het ministerie van Economische Zaken heeft in totaal € 45 miljoen gereserveerd voor de uitvoering van een innovatieprogramma Watertechnologie in de periode van 2006 tot 2010. Onderdeel van het innovatieprogramma is een subsidieregeling (InnoWATOR). InnoWATOR is bedoeld om kennis te vertalen naar nieuwe producten en diensten, bijvoorbeeld op het gebied van afvalwaterzuivering of drinkwater. Met de regeling kunnen projectvoorstellen worden ondersteund voor samenwerking van bedrijven en kennisinstellingen aan onderzoek en ontwikkeling voor innovaties.